perjantai 9. kesäkuuta 2023

Proteiinien uudelleenkoodaus voi auttaa mustekaloja sopeutumaan lämpötilan muutoksiin

 


Kuva: D.J. Schuessler Jr/Shutterstock. 
Joel Kontinen 

Mustekalat voivat sopeutua lämpötilan muutoksiin säätämällä geneettistä koodiaan muuttamaan niiden hermosoluissa muodostuvia proteiineja.

Aiemmat tutkimukset ovat osoittaneet, että pääjalkaisilla, kuten kalmarilla ja mustekaloilla on vertaansa vailla oleva kyky muokata RNA:taan. Nämä "lähettiläs"-molekyylit kuljettavat kopion geneettisistä ohjeista DNA:sta solun osiin, joissa valmistetaan proteiineja. Mutta oli epäselvää, miksi eläimet tekevät niin tai mitä vaikutuksia sillä on.

Joshua Rosenthal Marine Biological Laboratoryssa Woods Holessa, Massachusettsissa, ja hänen kollegansa testasivat, kuinka Kalifornian kaksipistemustekalat (Octopus bimaculoides) reagoivat veden lämpötilan muutoksiin säiliöissä.

He siirsivät lämpötilaa asteittain noin 13 °C:seen (55 °F) yhdelle ryhmälle ja 22 °C:seen (72 °F) toiselle ryhmälle. Kylmemmän säiliön mustekalat tekivät yli 13 000 muokkausta RNA:hansa, mikä johti muutoksiin tuloksena olevissa proteiineissa.

"On houkuttelevaa ajatella, että ne tekevät tämän sopeutuakseen muuttuneeseen ympäristöön, ja tässä osoitamme, että ne voivat tehdä niin ainakin yhteen ympäristöolosuhteisiin eli lämpötilaan", Rosenthal sanoo.

Monilla eläimillä, niin kuin ihmisilläkin on entsyymejä, jotka voivat vaihtaa kirjaimia RNA:ssa muuttaakseen näitä ohjeita. Useimmilla eläimillä useimmat muokkaukset kuitenkin tapahtuvat ei-koodaamassaan RNA:ssa – toisin sanoen RNA:ssa, jota ei muunneta proteiiniksi. Nämä muokkaukset voivat silti olla hyödyllisiä muilla tavoilla; ne voivat esimerkiksi vaikuttaa siihen, miten immuunijärjestelmämme solut kehittyvät tai aktivoituvat.

"Mielenkiintoista pääjalkaisissa on se, että ne koodaavat uudelleen proteiineja suuruusluokkaa, joka on paljon suurempi kuin mikään muu laji tai mikään muu tuntemamme eläinperhe", sanoo Eli Eisenberg Tel Avivin yliopistosta Israelista, joka myös työskenteli tutkimuksessa. Hänen mukaansa syytä tähän ei ole täysin tiedossa.

Kaksi proteiineista, jotka muuttuivat merkittävästi lämpötilan vaikutuksesta, olivat kinesiini-1 ja synaptotagmiini, jotka molemmat ovat kriittisiä hermoston toiminnalle.

Kinesiini-1 on vastuussa kemiallisten aineiden kuljettamisesta pitkien mikrotubulusten läpi neuronien sisällä, jotka voivat ulottua metrin pituisiksi. Matkustaessaan kinesiinit näyttävät kävelevän pienillä jaloilla. RNA-muokkaus muutti osaa kinesiinin "jalassa", jossa se yhdistyy mikrotubuluksiin, jolloin se kulkee hitaammin alemmissa lämpötiloissa.

Synaptotagmiinia löytyy synapseiksi kutsuttujen neuronien välisistä yhteyksistä, joissa se havaitsee kalsiumtasot ja laukaisee kemiallisten viestien vapautumisen solusta toiseen. RNA-muokkaus aiheutti synaptotagmiiniproteiineilla alhaisemman affiniteetin kalsiumiin alhaisemmissa lämpötiloissa.

Eisenberg sanoo, että on liian aikaista tietää, kuinka nämä muutokset voisivat saada mustekalat paremmin sopeutumaan kylmään. "Tuhannet proteiinit eroavat toisistaan kylmässä ja lämpimässä, joten on hyvin monimutkaista ymmärtää, kuinka ne kaikki toimivat yhdessä antamaan mustekalalle sietokykyä lämpötilan muutoksille."

Tutkijoiden mielestä muutosten tapahtumisaikataulu viittaa kuitenkin siihen, että nämä muutokset sopivat paremmin vuodenaikojen lämpötilaeroihin kuin äkillisiin muutoksiin, kuten vesivirtojen aiheuttamiin muutoksiin.

Jin Billy Li Kalifornian Stanfordin yliopistosta sanoo, että näiden muutosten taustalla olevat tarkat tekijät ovat edelleen mysteeri. "Mielestäni on reilua sanoa, että emme tiedä mekanismia, miksi lämpötilasta riippuvat muutokset tapahtuvat."

Mustakalat ovat älykkäitä ja niiden kyky sopeutua kylmään johtuu älykkäästä suunnittelusta.

Lähde:

 Kwan,  Jacklin. 2023. Octopuses edit their own genetic code to adapt to colder water NewScientist  8.6.